Isolasi DNA dan Amplifikasi, (PCR) Genom DNA kopi (Coffea Sp ) Melalui Proses Elektroforesis Gel Poliakrilamid

Rahman Hairuddin

Abstract


Tujuan Penelitian ini adalah mengetahui hubungan kekerabatan genom kopi melalui proses gel Poliakrilamid. Penelitian ini dilaksanakan di laboratorium Biologi Molekuler Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian, Balai Penelitian Tanaman Serealia, yang di mulai pada bulan Januari sampai dengan Maret 2013. Metode yang digunakan adalah ekstraksi DNA, Pengujian kualitas dan kuantitas DNA dengan tehnik elektroforesis menggunakan gel agarose, Pengenceran DNA dan teknik PCR. Materi genetik yang digunakan sebanyak enam aksesi daun kopi jenis Robusta hasil koleksi dari Bengkulu. Hasil penelitian bahwa besaran konsentrasi DNA dari nano spektrophotometer dan elektroforesis horisontal memiliki besaran yang berbeda di sebabkan karena semua molekul-molekul terbaca melalui nano spektrophotometer sedangkan elektroforesis horizontal tidak dan persentase polimorfisme dan Polymorphic Information Content (PIC) diperoleh nilai 0,00 yang menunjukkan tingkat monomorfis pada ke enam sampel serta karakter yang ditunjukkan oleh primer SSRca026 sama pada ke lima aksesi yang di analisis.

References


Dillon, W.R. and M. Goldstein. 1984. Multivariate analysis methods and applications. Jhon Willey and sons.pp.581.

Durbin, J. R.1979. Modern Algebra. John Wiley & Sons Inc. New York.

Epplen, J.E., dan T. Lubjuhn. 1999. DNA profiling and DNA fingerprinting. Birhkhauser Verlag, Berlin.

George M.L.C. dan E.S. Regalado. 2004. Buku Panduan Laboratorium: Lokakarya Teknik Dasar Molekμler untuk Pemμliaan Tanaman. Balai Penelitian dan Pengembangan Penelitian. Bogor.

Rohlf, F.J. 2000. NTSYSpc numerical taxonomy and mμltivariate analysis system version 2.1. Applied Biostatistics inc.

Smith,J.S.C., E.C.L Chin H.shu, O.S. Smith S.J Wall, M.L. Senior S.E. Mitchell ,S. Kresvoich ,and J. Zieglw. 1997.

Weir, B.S. 1996. Genetic data analysis. II .2nd ed. Sinauer Associates. Inc, Sunderland.


Refbacks

  • There are currently no refbacks.